民非组织投资开办另一民非组织后，投资款应作为出资投入被投资民非组织的运营中，并按照相关法律法规及章程规定进行管理和使用。具体分析如下：

一. 投资款的性质与处理

1. 投资款的性质：民非组织投资开办另一民非组织，其投资款实质上是对被投资组织的出资，用于支持被投资组织的设立和运营。
2. 投资款的处理：投资款一旦投入，即成为被投资民非组织的财产，应按照被投资民非组织的章程、财务管理制度以及相关法律法规进行管理和使用。

二. 相关法律法规依据

• 根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》等相关法律法规，民非组织应依法进行财务管理，确保资金的合理使用和保值增值。
• 投资款作为出资，应纳入被投资民非组织的财务账户，并按照章程规定用于组织的日常运营、项目开展等活动。

三. 投资款的管理与使用建议

1. 建立健全财务管理制度：被投资民非组织应建立健全财务管理制度，明确投资款的入账、使用、监管等流程，确保资金的透明度和安全性。
2. 遵循章程规定：投资款的使用应严格遵循被投资民非组织的章程规定，不得挪作他用或违反法律法规。
3. 加强监管与审计：民非组织应加强对投资款的监管和审计，确保资金使用的合法性和合规性，同时保障投资方的合法权益。

我建议：民非组织在投资开办另一民非组织时，应明确投资款的性质、处理方式和管理要求，确保资金的合理使用和保值增值。同时，被投资民非组织也应加强财务管理和监管，确保投资款的安全和有效使用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。