流动动物马戏团是否合法，需根据具体情况判断。

1. 从野生动物保护角度：

   • 根据《中华人民共和国野生动物保护法》第二十七条（或第二十八条，依据不同版本的法条可能有所不同），利用国家重点保护野生动物进行公众展示展演，需要获得相关林业主管部门的批准。若马戏团中的动物属于国家重点保护野生动物，且未获得相应的批准，则该马戏团的表演活动属于违法行为。
   • 在实际案例中，如河北吴桥一马戏团因未提供“出售、购买和利用国家重点保护野生动物”的许可而被责令停业整顿。

2. 从营业性演出角度：

   • 马戏团作为营业性演出单位，需要按照相关规定办理营业性演出备案。若未进行备案或备案不合法，则不能开展营业性演出活动。
   • 在上述河北吴桥马戏团的案例中，该马戏团虽取得了《营业性演出许可证》，但尚未在东营区进行演出备案，因此也被责令停业整顿。

3. 从儿童保护角度：

   • 若马戏团中使用未成年人进行表演，且未遵守《中华人民共和国禁止使用童工规定》等相关法律法规，也可能构成违法行为。
   • 在上述案例中，马戏团中的两名未成年演员在表演中跌落，虽未造成严重后果，但也引发了社会对马戏团使用未成年演员的关注。

综上所述，流动动物马戏团的合法性取决于其是否遵守了野生动物保护、营业性演出以及儿童保护等相关法律法规。若马戏团存在违法行为，将可能面临行政处罚等法律后果。因此，建议马戏团在开展活动前，务必确保自身行为的合法性，并遵守相关法律法规的规定。