投标保函中的受益人应当写招标人。以下是对此问题的详细分析：

一. 受益人身份的确定

1. 投标保函的性质：投标保函是投标人（即承包商）向招标人（即业主）提供的一种担保，保证在投标人中标后，能够按照招标文件的要求与招标人签订合同，并履行合同中的义务。若投标人未能履行这些义务，则招标人有权根据投标保函的约定，要求担保人（通常是银行或保险公司）承担赔偿责任。

2. 受益人的定义：在投标保函中，受益人是指有权根据保函条款要求担保人承担赔偿责任的一方。在招标活动中，招标人是发布招标公告、接收投标文件、组织评标并确定中标人的主体，也是投标人需要履行合同义务的对象。因此，投标保函的受益人应当是招标人。

3. 招标代理公司的角色：招标代理公司通常受招标人的委托，代为办理招标事宜，如编制招标文件、发布招标公告、组织开标评标等。虽然招标代理公司在招标活动中扮演重要角色，但它并不是投标保函的受益人。招标代理公司的行为是基于招标人的委托和授权，其法律后果由招标人承担。

二. 法律依据

• 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关法律法规的规定，投标保函是投标人向招标人提供的一种担保方式，用于保证投标人在中标后能够履行合同义务。这些法律法规并未规定招标代理公司为投标保函的受益人。

三. 实践中的操作

• 在实际操作中，投标保函的受益人通常明确写为招标人的名称，以确保在投标人未能履行合同义务时，招标人能够依据投标保函的约定要求担保人承担赔偿责任。

综上所述，投标保函中的受益人应当写招标人，而不是招标代理公司。这是基于投标保函的性质、受益人的定义、法律法规的规定以及实践中的操作习惯所得出的结论。如有进一步需要，您可以继续咨询我。