业主让垫资，施工单位将风险转嫁给农民工是违法的。

首先，从法律角度来看，业主让施工单位垫资本身可能涉及合同约定的问题，但这并不是将风险转嫁给农民工的合法理由。施工单位作为雇主，有责任按照劳动合同约定向农民工支付工资，这是其基本的法律义务。

其次，如果施工单位因为业主垫资的问题而无法按时支付农民工工资，这实际上构成了对农民工合法权益的侵害。根据《劳动法》和相关规定，用人单位应当按时足额支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠。因此，施工单位将风险转嫁给农民工，不支付或延迟支付工资，是违反法律的行为。

再者，从道德和公平的角度来看，农民工提供了劳动，理应获得相应的报酬。施工单位将风险转嫁给农民工，不仅损害了农民工的合法权益，也违背了社会公平和正义的原则。

综上所述，业主让垫资，施工单位将风险转嫁给农民工是违法的。农民工在遇到此类情况时，可以依法向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径维护自己的合法权益。同时，施工单位也应该遵守法律法规，切实履行支付工资的法律义务。