加班费按照最低工资发放，在多数情况下是不合法的。正确的做法应该是根据劳动者的实际工资以及法定的加班费支付标准来计算加班费。以下是对这一问题的详细分析：
一、不合法的情况
劳动合同或集体合同有明确约定：
- 如果劳动合同或集体合同中明确约定了劳动者的工资数额，且该工资数额高于当地最低工资标准，那么加班费应当以约定的工资作为计算基数，而非最低工资标准。
正常出勤月工资标准：
- 在没有特定约定的情况下，加班费应当按照劳动者正常出勤月工资的70%来确定计算基数，但这一基数同样不得低于当地最低工资标准。然而，这并不意味着加班费就可以按照最低工资标准计算，而是应以实际工资为基础进行核算。
法定加班费支付标准：
- 根据《劳动法》规定，工作日加班的加班费应不低于本人小时工资标准的1.5倍；休息日加班又不能安排补休的，加班费应不低于本人日或小时工资标准的2倍；法定节假日加班的，加班费应不低于本人日或小时工资标准的3倍。因此，按照最低工资标准计算加班费将违反这一法定标准。
二、合法的情况
- 在极少数情况下，如果劳动者的正常出勤工资就是当地最低工资标准，且劳动合同或集体合同中明确约定加班费计算基数为最低工资标准（同时这些约定不违反法律、法规的强制性规定），那么按照最低工资标准计算加班费可能是合法的。然而，这种情况较为罕见，且必须确保所有相关约定均符合法律法规的要求。
劳动者权益保护
- 如果单位未按照劳动者的实际工资支付加班费，而是错误地采用了最低工资标准，劳动者有权要求单位进行纠正，并按照实际工资支付加班费。
- 如果单位拒绝改正，劳动者可以向当地的劳动监察部门进行投诉举报，以维护自己的合法权益。
综上所述，加班费按照最低工资标准计算在大多数情况下是不合法的。单位应严格按照劳动者的实际工资以及法定的加班费支付标准来计算和支付加班费，以确保劳动者的合法权益得到充分保障。如果您在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。