代理人存单被冻结的原因可能涉及多种情况，以下是一些主要的原因及解释：

一、涉及监察机关调查

当监察机关在调查涉嫌贪污贿赂、失职渎职等严重职务违法或者职务犯罪时，根据工作需要，可以依照规定查询、冻结涉案单位和个人的存款、汇款、债券、股票、基金份额等财产。这是监察机关为证实犯罪、追缴赃款而采取的重要手段，也是防止证据流失、赃款转移以及防止这些款项再次用于违法犯罪的有效措施。

二、涉及人民法院执行

如果代理人作为被执行人，未按执行通知履行法律文书确定的义务，并且隐瞒在银行的存款，那么人民法院有权向银行、信用合作社和其他有储蓄业务的单位查询被执行人的存款情况，并有权冻结、划拨被执行人的存款。这是人民法院执行工作中经常使用的执行措施，旨在对被执行人清偿所欠债务。

三、其他可能的原因

除了上述两种情况外，还有一些其他可能导致代理人存单被冻结的原因，如涉及其他法律纠纷、债务问题或银行内部的风险控制等。这些情况下，银行或相关机构可能会根据法律法规或内部规定对代理人的存单进行冻结。

综上所述，代理人存单被冻结的原因可能涉及监察机关调查、人民法院执行以及其他法律纠纷或债务问题等。在面临存单被冻结的情况时，建议代理人及时了解冻结的具体原因，并咨询相关专业人士以寻求合适的解决方案。