在非法经营罪案件中，即使退还了非法所得，犯罪嫌疑人仍有可能被判刑，但退还非法所得的行为可以作为量刑情节考虑，可能会减轻刑罚。
一、非法经营罪的构成与刑罚
《刑法》第二百二十五条规定，非法经营罪是指违反国家规定，实施非法经营行为，扰乱市场秩序，情节严重的行为。一旦构成非法经营罪，犯罪嫌疑人将面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金的处罚；情节特别严重的，将处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
二、退还非法所得的法律意义
不影响定罪：退还非法所得并不改变犯罪行为的性质，也不意味着犯罪嫌疑人可以逃避法律的制裁。非法经营罪的构成是基于违反国家规定和扰乱市场秩序的行为，退还非法所得并不影响犯罪的构成和定罪。
可从轻量刑：退还非法所得在量刑过程中具有重要的积极意义。主动退还非法所得被视为犯罪后的悔罪表现，表明犯罪嫌疑人主观上有认罪、悔罪的态度，客观上也减少了犯罪行为所造成的危害后果。因此，司法机关在量刑时会将这一情节纳入考量，对被告人从轻处罚，甚至在符合一定条件下，有可能适用缓刑。
三、实际案例与操作建议
在实际案例中，法院在判决非法经营罪时，会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、悔罪表现以及退还非法所得的情况。如果犯罪嫌疑人能够积极配合调查，主动退还非法所得，并表现出真诚的悔罪态度，那么法院在量刑时往往会给予一定的从宽处理。
因此，在涉嫌非法经营时，建议犯罪嫌疑人积极配合调查，及时退还非法所得，并咨询专业律师以了解自己的法律权益和义务。这些行为不仅有助于表明自己的悔罪态度，还可能为争取从宽处理创造有利条件。
综上所述，退还非法所得虽然不能直接免除刑事责任，但作为悔罪表现，在量刑时具有积极作用。在面临非法经营罪指控时，积极退赃并配合调查是明智的选择。如果你有任何关于非法经营罪或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。