非法采矿案件的违法线索主要包括以下几个方面：

1. 无证采矿的线索：

   • 例如，发现某企业或个人在未依法取得采矿许可证的情况下，擅自进入国家规划矿区、对国民经济具有重要价值的矿区和他人矿区范围采矿，或开采国家规定实行保护性开采的特定矿种。这种情况下的无证采矿行为，是明显的非法采矿线索。

2. 超越批准范围采矿的线索：

   • 如某企业虽已取得采矿许可证，但超出许可证所规定的开采范围、矿种进行开采。这可以通过对比企业的实际开采情况与许可证规定的开采范围、矿种来发现线索。

3. 持过期失效许可证采矿的线索：

   • 当发现某企业的采矿许可证已过期或因各种原因被吊销、注销后，仍然继续进行采矿作业时，这就构成了持过期失效许可证采矿的线索。可以通过检查企业的采矿许可证有效期和状态来识别。

4. 以探代采的线索：

   • 这种情况下，企业或个人可能打着勘探的幌子，实际从事开采活动。这可以通过观察其勘探活动是否超出了正常的勘探范围，以及是否有大规模的矿石采挖、提炼等开采作业来发现线索。

5. 擅自开采禁采区矿产的线索：

   • 如果发现某企业或个人在国家划定的禁止开采区域内进行采矿活动，如在自然保护区、风景名胜区、饮用水水源保护区等依法设立的保护区内开采矿产资源，这就构成了擅自开采禁采区矿产的线索。

6. 采取破坏性方法开采矿产资源的线索：

   • 在采矿过程中，如果企业或个人使用破坏性的方法，导致矿产资源浪费和生态环境破坏，这也构成了非法采矿的线索。可以通过观察其采矿方法是否对矿产资源和生态环境造成了严重破坏来发现。

综上所述，非法采矿案件的违法线索主要包括无证采矿、超越批准范围采矿、持过期失效许可证采矿、以探代采、擅自开采禁采区矿产以及采取破坏性方法开采矿产资源等方面。这些线索的发现需要依靠相关部门的监管、群众的举报以及企业的自律等多方面的努力。