单位自己打井是否违法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下违法
法律依据：
- 根据《中华人民共和国水法》和相关管理条例，国家对水资源实行取水许可制度和有偿使用制度。任何单位和个人，包括单位，想要利用水资源，都必须事先申请并获得相关的取水许可，并缴纳水资源费。
- 未经批准擅自打井取水，属于违法行为。县级以上人民政府水行政主管部门或流域管理机构有权责令停止违法行为，并可能处以罚款。情节严重的，还可能面临更严厉的处罚，甚至构成犯罪，需要依法追究刑事责任。
城市供水规定：
- 在城市公共供水管网覆盖范围内，通常不允许新建公共供水以外的其他供水设施。因此，单位在城市内私自打井供水也是被禁止的，违反者将面临相应的行政处罚。
二、特殊情况可能合法
少量取水情形：
- 如果单位打井是为了满足少量、特定的用水需求（如科研、实验等），并且符合当地关于水资源保护和管理的规定，可能不需要申请取水许可。但这种情况下，也需要事先咨询当地水行政主管部门，确保行为合法。
其他特殊规定：
- 在某些特殊地区或特殊情况下，政府可能会允许单位在符合一定条件下自行打井取水。但这通常需要经过相关部门的审批和备案，并遵守严格的管理规定。
三、综合建议
咨询与申请：
- 单位在打算打井之前，应首先咨询当地水行政主管部门或法律专业人士，了解相关法律法规和政策要求，并依法申请取水许可（如需）。
合规操作：
- 如果获得取水许可，单位应严格按照许可的要求进行取水活动，并遵守相关管理规定。如果未获得许可或不符合许可要求，应停止打井和取水行为，以避免可能的法律风险和处罚。
水资源保护：
- 单位应增强水资源保护意识，合理利用水资源，避免过度开采和浪费。同时，应关注地下水资源的可持续利用和生态保护问题。
总之，单位自己打井是否违法取决于具体情况和法律法规的规定。建议单位在打算进行打井活动之前，务必咨询当地水行政主管部门或法律专业人士，确保行为合法合规。