在被告没有抗辩格式条款合同无效情况下，法庭可以主动认定合同是格式条款。

首先，我们需要明确格式合同的认定标准。根据相关法律法规及实务经验，格式合同通常具备以下特征：面向不特定公众，规定了某一特定时期订立该合同的全部条款；合同条款是单方事先制作的；合同条款的指定方处于一定的优势地位；合同条款定型化，基本不允许双方协商。如果合同满足这些条件，法庭可以认定其为格式合同。

接下来，我们分析法庭在被告未抗辩格式条款合同无效时的主动认定权。法庭在审理案件时，有责任对合同的性质和条款进行审查，以确保合同的合法性和公平性。即使被告未提出格式条款合同无效的抗辩，法庭在审查过程中发现合同存在格式条款的特征，且这些条款可能损害消费者权益或违反公平原则时，仍然可以主动认定合同为格式合同，并对相关条款的效力进行评判。

此外，法庭的主动认定并不违反法律原则。在民事诉讼中，法庭有权根据案件事实和法律规定，对合同的性质和效力进行独立判断。被告未抗辩格式条款合同无效，并不影响法庭对合同性质的认定和对条款效力的审查。

综上所述，即使被告未抗辩格式条款合同无效，法庭在审查案件过程中仍可以主动认定合同为格式合同，并对相关条款的效力进行评判。这是法庭在审理案件时履行其职责和保障公平正义的体现。