手写离婚协议通常需要一式三份。这三份的具体分配如下：
夫妻双方各持一份：这样做主要是方便日后双方查看协议条款，以及处理与离婚相关的各项事宜时作为依据。
婚姻登记机关存档一份：这一份是办理离婚登记时，婚姻登记机关需要留存的，它是双方自愿离婚及就子女抚养、财产分割等问题达成一致的重要凭证。
关于手写离婚协议份数不足的问题，虽然份数不足通常不影响协议本身的法律效力，但可能会带来一些法律风险和实际操作上的不便。例如，在办理离婚登记时，如果份数不足，婚姻登记机关可能会要求补充，否则可能不予办理离婚登记。在后续履行过程中，若一方对协议内容有争议，另一方若无法及时提供协议文本进行核对，可能会引发纠纷。因此，为了确保离婚流程的顺利进行以及双方权益的有效保障，建议按照要求准备足够份数的离婚协议。
总的来说，手写离婚协议一式三份是标准做法，这样既能保障双方的合法权益，也能便于相关部门的审核和处理。在签订和准备离婚协议时，务必确保内容的清晰、明确和合法性，并仔细核对份数，以确保整个离婚流程的顺利进行。