公司在有债务期间未告知债权人私自变卖厂房的行为，通常是不合法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，公司在处理重大资产时，应遵守相应的法律程序，特别是当这些资产的处理可能影响到公司债权人的利益时。
   • 《中华人民共和国民法典》中也对债务人的财产处分行为进行了规范，要求债务人在处分其财产时，不得损害债权人的利益。

2. 具体分析：

   • 信息透明与告知义务：公司在有债务的情况下，对于其资产的重大变动，如变卖厂房，应负有向债权人告知的义务。这是为了确保债权人的知情权，以便债权人能够及时了解公司的财务状况，并作出相应的决策。
   • 资产处分的合法性：如果公司未经债权人同意或未按照法定程序私自变卖厂房，这可能构成对债权人利益的侵害。特别是在公司资不抵债或濒临破产的情况下，这种私自处分资产的行为可能被视为非法转移资产，逃避债务。
   • 法律后果：如果公司确实存在私自变卖厂房且未告知债权人的行为，债权人可以依法向法院提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任，包括但不限于赔偿损失、恢复资产原状等。

3. 建议：

   • 对于公司而言，应严格遵守相关法律法规，确保在处理资产时遵循法定程序，并充分告知债权人相关信息。
   • 对于债权人而言，应密切关注公司的财务状况和资产变动情况，如发现公司存在违法处分资产的行为，应及时采取法律措施维护自己的合法权益。

综上所述，公司在有债务期间未告知债权人私自变卖厂房的行为通常是不合法的。这种行为不仅违反了法律法规，也损害了债权人的利益。因此，建议公司在处理资产时应谨慎行事，确保遵守相关法律法规和程序。