转让经营权涉及的案由主要包括合同纠纷、侵权纠纷以及与行政相关的纠纷。以下是详细分析：

一. 合同纠纷

1. 确认合同效力纠纷：在经营权转让过程中，若合同存在影响效力的因素，如签订合同的当事人无民事行为能力、合同内容违法、存在欺诈胁迫等情形，可能会引发确认合同效力纠纷。

2. 合同履行纠纷：合同签订后，若一方未按照合同约定履行义务，如未支付转让款、未协助办理相关变更手续等，会产生合同履行纠纷。

3. 合同解除纠纷：在合同履行过程中，若出现解除事由，一方主张解除合同而另一方不同意，或解除合同后的相关事宜存在争议，会引发合同解除纠纷。

4. 特定领域合同纠纷：如农村土地承包经营权转让中的权属争议、承包合同纠纷、流转纠纷等；商业特许经营权转让中的合同纠纷、侵权行为等；公司、店铺经营权转让中的转让合同纠纷、租赁纠纷等。

二. 侵权纠纷

1. 侵害经营权纠纷：未经合法授权或违反合同约定，擅自干涉、阻碍另一方行使经营权，会构成侵害经营权纠纷。

2. 商业秘密侵权纠纷：在经营权转让过程中，若一方泄露或不当使用另一方的商业秘密，会引发商业秘密侵权纠纷。

三. 与行政相关的纠纷

• 行政许可变更纠纷：经营权转让通常需要办理行政许可变更手续，若行政机关拒绝办理或存在违法行为，会导致行政许可变更纠纷。

综上所述，转让经营权涉及的案由多种多样，具体案由需根据纠纷的实际情况来确定。在处理此类纠纷时，建议首先明确纠纷性质，然后选择适当的处理方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。如有进一步需要，您可以继续咨询我。