指示付款确认书在法律上并没有明确的合法性界定，其效力主要取决于其具体内容、签署方式以及实际用途，需结合相关法律法规和具体情境进行综合判断。

一. 指示付款确认书的内容与形式

1. 内容明确性：指示付款确认书应明确指示付款的金额、收款人、付款时间等关键信息。若内容模糊、不明确，可能导致其法律效力受到质疑。
2. 签署方式：通常，书面签署并加盖公章或合同专用章的指示付款确认书具有更高的法律效力。电子签名在符合《电子签名法》相关规定的情况下，也具备法律效力。

二. 指示付款确认书的实际用途

1. 作为付款指令：若指示付款确认书仅作为付款指令使用，且得到付款方和收款方的认可，那么在实际操作中，它可能被视为一种有效的付款依据。
2. 作为合同附件：若指示付款确认书作为合同的附件，与主合同共同构成完整的交易协议，那么其法律效力将受到主合同法律效力的影响。

三. 相关法律法规

1. 《中华人民共和国合同法》：虽然该法并未直接规定指示付款确认书的合法性，但合同的有效性需满足合同主体合格、内容合法、意思表示真实等条件。指示付款确认书若作为合同的一部分，也应遵循这些原则。
2. 《电子签名法》：对于电子形式的指示付款确认书，需符合该法关于电子签名的相关规定，以确保其法律效力。

我的观点：指示付款确认书的合法性并非绝对，而是取决于其具体内容、签署方式以及实际用途。在签署和使用指示付款确认书时，建议双方明确其性质、用途和法律效力，并尽可能采用书面签署并加盖公章或合同专用章的方式，以确保其法律效力。如有进一步需要，您可以继续咨询我。