关于婚姻行政机关发现过追诉期的无效婚姻如何处理，首先我们要明确一点：婚姻行政机关对于超过追诉期的无效婚姻，一般不会主动进行干预或处理。下面我详细解释一下这个结论及相关的法律依据和处理方式。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国婚姻法》及相关司法解释的规定，无效婚姻包括重婚、有禁止结婚的亲属关系、未到法定婚龄等情形。但这些无效婚姻的确认权主要在人民法院，而非婚姻行政机关。
- 同时，法律也规定了无效婚姻的确认请求权行使的期限，即当事人依据婚姻法规定向人民法院请求确认婚姻无效的，申请时，法定的无效婚姻情形已经消失的，人民法院不予支持。这实际上也暗示了超过一定期限后，无效婚姻的确认问题将不再由法律主动介入。
处理方式：
- 不主动干预：婚姻行政机关在发现无效婚姻时，如果已经超过追诉期，一般不会主动宣告婚姻无效或进行其他干预措施。因为此时婚姻的无效性已经失去了法律上的追诉意义。
- 建议咨询：如果当事人对婚姻的有效性存在疑问或争议，即使超过追诉期，也可以咨询专业律师或法律机构，了解自身的法律权益和可能的解决方案。
- 民事诉讼：在某些特殊情况下，如果无效婚姻的存在对当事人造成了实际的法律困扰或损害，当事人仍然可以通过民事诉讼的方式寻求法律救济，但这需要依据具体的法律事实和法律规定来判断。
综上所述，婚姻行政机关对于超过追诉期的无效婚姻一般不会主动处理，但当事人可以咨询专业律师或法律机构以获取更具体的法律建议。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。