公司申请破产后，债务的处理是一个法定且有序的过程。以下是对这一过程的详细解答：

一、债务处理的基本流程

1. 法院受理与指定管理人：

   • 当公司申请破产后，法院会受理该申请，并指定一个管理人。
   • 管理人会接管公司的财产、印章、账簿等相关资料，并对公司的财产状况进行调查，编制财产状况报告。

2. 债权人申报债权：

   • 管理人会通知债权人申报债权，债权人需要在规定的期限内进行申报。
   • 申报的债权会在债权人会议上进行核查。

3. 债务清偿顺序：

   • 破产费用和共益债务会首先得到清偿。
   • 接着是职工债权，包括工资、医疗等费用。
   • 然后是社会保险费用和破产人所欠税款。
   • 最后是普通破产债权，如贷款债务等。

4. 财产分配与程序终结：

   • 当破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求时，会按照比例进行分配。
   • 破产程序终结后，未得到清偿的债务会消灭，债权人不能再向公司主张。

二、特殊债务的处理

1. 有担保的债权：

   • 有担保的债权，其担保财产不属于破产财产。
   • 担保债权人可以就该财产优先受偿。

2. 股东股份的处理：

   • 股东对公司的债务承担有限责任，以其认缴的出资额或认购的股份为限。
   • 在破产程序中，公司财产会进行清算。若公司资不抵债，股东的股份价值可能大幅缩水甚至归零。
   • 清算后有剩余财产，会按股东持股比例进行分配。

三、债权人的权益保障

1. 申报债权：

   • 债权人应在规定期限内申报债权，以便参与分配。
   • 若对债务清偿有异议，可以通过合法途径提出。

2. 关注破产程序进展：

   • 债权人应密切关注破产程序的进展，以确保自身权益得到保障。

综上所述，公司申请破产后，债务会按照法定程序进行处理。债权人需要了解并遵循这一程序，以确保自身权益得到最大程度的保障。同时，对于特殊债务和股东股份的处理，也需要根据具体情况进行合理安排。