单位套取国家资金的立案标准，主要依据套取资金的数额以及行为性质来确定。以下是详细的解释：

一、套取国家专项资金的立案标准

单位套取国家专项资金，如果达到5万元以上，通常就符合立案标准。这是因为套取国家专项资金不仅侵害了国家的财产权益，还干扰了国家正常的财政管理秩序。对于此类行为，法律将严肃追究责任。

二、与诈骗罪相关的立案标准

如果单位以非法占有为目的，通过虚构事实、隐瞒真相等诈骗手段套取国家资金，那么即使套取的资金未达到上述专项资金的立案标准，但如果达到了一般诈骗罪的立案标准（即3000元以上），也可能以诈骗罪立案侦查。这种情况下，单位的行为将同时触犯诈骗罪和套取国家资金的相关规定，需依法严惩。

三、其他相关法律规定

除了上述立案标准外，还需要注意的是，如果国家工作人员利用职务上的便利套取国家资金归个人占有，可能构成贪污罪；如果国家机关工作人员滥用职权或者玩忽职守，致使国家资金被套取，造成公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的，可能构成滥用职权罪或玩忽职守罪。

综上所述，单位套取国家资金的立案标准主要依据套取资金的数额和行为性质来确定。对于此类违法行为，法律将严肃追究责任，以维护国家的财产权益和财政管理秩序。同时，也提醒各单位和个人要严格遵守法律法规，不得非法套取国家资金。