即使电动自行车轻微事故逃逸后双方已协商解决，交警仍然有可能对逃逸者进行处罚。下面我将详细解释这一结论：

一、肇事逃逸的法律性质

肇事逃逸是违反《中华人民共和国道路交通安全法》的行为，该法明确规定，造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的，公安机关交通管理部门将处以相应的罚款，并可并处拘留。这一规定体现了法律对肇事逃逸行为的严厉打击态度，旨在维护公共交通安全和秩序。

二、对方谅解的法律效力

虽然事故双方已经协商解决，受害者对逃逸者表示了谅解，但这并不能免除逃逸者的法律责任。因为肇事逃逸行为不仅是对受害者的侵害，也是对公共交通秩序的破坏。对方的谅解主要影响的是民事赔偿责任方面，即受害者不再追究逃逸者在民事赔偿上的责任，但这并不影响行政处罚的执行。

三、交警的处罚权

交警部门作为执法机关，有权对违反交通法规的行为进行处罚。在肇事逃逸的情况下，无论事故大小，逃逸行为本身都是不被法律所容忍的。因此，即使双方已经协商解决，交警仍然有权对逃逸者进行处罚，以维护公共交通秩序和安全。

四、具体的法律后果

1. 行政处罚：交警部门会根据肇事逃逸的具体情节，对逃逸者处以罚款、扣分等行政处罚。这些处罚措施旨在警示逃逸者，并维护公共交通安全和秩序。
2. 民事责任：虽然双方已经协商解决，但逃逸者仍需承担因事故造成的财产损失赔偿责任。对方的谅解只是放弃了对其民事赔偿责任的追究，但并不影响这一责任的客观存在。

五、总结与建议

综上所述，电动自行车轻微事故逃逸后，即使双方已协商解决，交警仍然有可能对逃逸者进行处罚。因此，建议驾驶者在发生交通事故后，应第一时间停车、保护现场、抢救伤者，并积极配合交警部门的调查处理，切勿选择逃逸，以免面临更严重的法律后果。同时，也提醒广大驾驶者要严格遵守交通法规，确保行车安全，共同维护良好的交通秩序。