偷渡案件主要由公安机关（边防管理部门）和海关部门共同负责管辖。
公安机关（边防管理部门）：
- 主要职责：打击非法出入境活动，包括组织、运送他人偷越国（边）境的行为；对涉嫌偷渡的人员进行侦查、拘留、逮捕等法律措施；维护国家边境的安全与稳定，防止非法移民对国家安全和社会秩序造成威胁。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第三百二十二条，违反国（边）境管理法规，偷越国（边）境，情节严重的，构成偷越国（边）境罪，将受到相应的刑事处罚。
海关部门：
- 主要职责：在口岸对进出境人员、货物、物品进行监管，防止非法移民通过藏匿、伪装等方式进入或离开国境；与海关等部门协作，共同打击偷渡等违法犯罪活动。
- 协作机制：海关在查验过程中发现涉嫌偷渡的人员或线索时，应及时通报公安机关进行处理；公安机关在侦查过程中需要海关协助的，海关应积极配合并提供相关支持。
综上所述，偷渡案件涉及多个部门的协作与配合，以确保国家边境的安全与稳定。如果你或他人涉嫌偷渡或相关违法犯罪活动，请务必遵守法律法规，并主动向相关部门投案自首或举报。