林权入股公司后被国家征占，赔偿款一般归公司所有。以下是详细分析：

首先，我们需要明确林权入股的性质。林权入股，即林权人将其享有的林权作为出资，投入到公司中，成为公司财产的一部分。一旦林权入股，林权的所有权就转移给了公司，林权人成为公司的股东，享有股权，而不再直接享有林权的所有权。

接下来，我们分析国家征占的情况。国家征占，是指国家为了公共利益的需要，依法对土地、林木等资源进行征收或征用，并给予相应补偿的行为。当公司享有的林权被国家征占时，国家会给予相应的赔偿款。

那么，这款赔偿款应该归谁呢？根据《公司法》的相关规定，公司的财产归公司所有，股东以其出资为限对公司承担责任，并享有相应的权益。因此，当公司享有的林权被国家征占时，赔偿款应该归公司所有，而不是归原林权人所有。

当然，具体情况还需要根据公司的章程、股东协议以及国家征占的具体政策来确定。如果公司章程或股东协议中有特别约定，或者国家征占政策中有特别规定，那么赔偿款的归属可能会有所不同。但一般来说，遵循上述原则进行处理是比较常见的。

综上所述，林权入股公司后被国家征占，赔偿款一般归公司所有。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。