针对“法院未确认股东身份怎么处理”的问题，以下是一些详细的解答和建议：

首先，需要明确的是，股东资格的确认是一个涉及公司法、公司章程以及实际出资情况等多方面因素的问题。当法院未确认股东身份时，通常意味着存在某些争议或不明确的地方，需要进一步的调查和审理。

一、明确争议点

1. 出资情况：检查该股东是否实际向公司缴纳了出资，以及出资是否符合公司章程和法律规定。
2. 股东名册与登记：查看公司股东名册、工商登记等文件，确认该股东是否被正式登记为股东。
3. 公司章程与协议：审查公司章程和股东之间的协议，了解是否有关于股东资格认定的特殊规定。

二、采取相应措施

1. 补充证据：根据争议点，收集并补充相关证据，如出资证明、股东名册、公司章程等，以支持自己的主张。
2. 与公司协商：尝试与公司进行协商，了解公司对于股东身份认定的态度和依据，寻求双方都能接受的解决方案。
3. 提起司法程序：如果协商无果，可以考虑向法院提起股东资格确认之诉，通过司法程序来明确股东身份。

三、注意事项

1. 及时性：股东资格纠纷应尽早解决，以避免对公司运营和股东权益造成不必要的影响。
2. 专业性：在处理股东资格纠纷时，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保护。
3. 遵循法律程序：在提起司法程序时，应严格遵循法律程序，确保诉讼的合法性和有效性。

四、后续建议

1. 完善公司治理：对于公司而言，应完善公司治理结构，明确股东资格的认定标准和程序，避免类似纠纷的再次发生。
2. 加强股东沟通：加强股东之间的沟通与合作，确保股东之间的信息畅通，减少误解和纠纷。
3. 关注法律法规变化：关注公司法和相关法律法规的变化，及时调整公司治理和股东资格认定的标准和程序。

综上所述，当法院未确认股东身份时，应明确争议点、采取相应措施、注意相关事项，并寻求专业律师的帮助。同时，公司也应加强治理和股东沟通，关注法律法规变化，以确保公司的稳定运营和股东权益的保护。