文化经营许可证被吊销的法律依据主要包括《互联网上网服务营业场所管理条例》第三十三条以及《中华人民共和国行政许可法》第七十条第一款的相关规定。

一. 《互联网上网服务营业场所管理条例》第三十三条

• 根据该条例第三十三条，互联网上网服务营业场所经营单位若违反本条例的规定，存在特定行为，如变更名称、住所、法定代表人等重要事项未向文化行政部门办理有关手续或备案的，由文化行政部门依据职权给予警告、罚款，直至吊销《网络文化经营许可证》。在本题中，部分上网服务经营场所因无实际经营行为三个月以上等异常经营情况，且未向文化行政部门备案，因此文化行政部门有权依据此条例吊销其《网络文化经营许可证》。

二. 《中华人民共和国行政许可法》第七十条第一款

• 根据该法第七十条第一款，若行政许可有效期届满未延续，或者法人、其他组织依法终止，以及存在其他法定情形，行政机关可以依法吊销行政许可。在本题中，部分文化经营单位已连续不在登记住所经营达6个月以上，且连续两年以上未按规定时间报送停业年度情况，涉嫌长期停业未经营，这符合《行政许可法》中关于吊销行政许可的法定情形。

综上所述，文化经营许可证被吊销的法律依据明确，主要包括《互联网上网服务营业场所管理条例》第三十三条以及《中华人民共和国行政许可法》第七十条第一款的相关规定。在实际操作中，文化行政部门会依据这些法律法规，对存在违规行为的经营单位进行查处，直至吊销其文化经营许可证。如有进一步需要，您可以继续咨询我。