非法人组织不能作为参与单位申请国家自然科学基金。以下是对这一结论的详细分析：

一. 申请国家自然科学基金的参与单位要求

根据《国家自然科学基金条例》及相关的申请规定，申请国家自然科学基金的参与单位应当具有独立法人资格。这是因为基金管理机构需要对依托单位的基金资助管理工作进行指导、监督，确保资金的合规使用和管理。而非法人组织由于不具备独立法人资格，无法独立承担法律责任，因此不符合作为参与单位的要求。

二. 非法人组织的法律地位

非法人组织，如合伙企业等，虽然可以依法进行民事活动，但其法律地位与法人不同。法人拥有独立的财产权、独立的诉讼主体资格等，而非法人组织则不具备这些特点。因此，在申请国家自然科学基金等需要独立法人资格的项目时，非法人组织无法作为参与单位。

三. 实际案例与操作建议

• 例如，在申请国家自然科学基金时，如果某个项目涉及多个单位合作，那么这些单位都必须是具有独立法人资格的单位。如果其中有非法人组织，那么该组织将无法直接作为参与单位申请基金。
• 在实际操作中，如果非法人组织希望参与国家自然科学基金的申请，可以通过与其有合作关系的法人单位进行联合申请。即，由法人单位作为主要申请单位，非法人组织作为协作单位或提供技术支持等方式参与项目。

四. 我的观点

综上所述，非法人组织不能作为参与单位申请国家自然科学基金。这是由国家自然科学基金的申请条件和非法人组织的法律地位所决定的。对于希望参与国家自然科学基金申请的非法人组织，建议通过与其有合作关系的法人单位进行联合申请，以实现项目的顺利进行和资金的合规使用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。