自诉案件未上诉和解后不会留有案底。

详细分析如下：

自诉案件是指由被害人或其法定代理人直接向法院提起诉讼，由法院直接受理的轻微的刑事案件。在自诉案件中，如果当事人双方达成和解，并且原告撤回起诉，那么案件就没有经过法院的实体审判。根据《刑事诉讼法》的相关规定，未经法院实体审判的案件，当事人是不会被判刑的，因此也就不会留有案底。

案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，该犯罪档案一般存放至公安部门与相关国家机关。由于自诉案件和解后未经实体审判，所以不存在这样的犯罪记录，也就不会留有案底。

综上所述，自诉案件未上诉和解后，是不会留有案底的。如果你还有其他法律问题，可以直接向我咨询。