妨害药品管理罪非法获利是算本金的。在妨害药品管理罪中，非法获利通常被视为犯罪所得的一部分，也即本金。这是因为非法获利是通过实施妨害药品管理的犯罪行为所获得的直接经济利益，它构成了犯罪行为的直接后果之一。

具体来说，妨害药品管理罪是指违反药品管理法规，实施了一系列妨害药品管理的行为，如生产、销售假药、劣药，或者未取得药品相关批准证明文件生产、进口药品等。这些行为不仅扰乱了药品市场秩序，还可能对公众健康造成严重危害。因此，法律对这类行为予以严厉打击，并对非法获利进行追缴。

在司法实践中，对于妨害药品管理罪的非法获利，通常会进行详细的计算和认定。这包括确定非法获利的来源、数额以及与之相关的犯罪事实。一旦非法获利被认定，它将被视为犯罪所得的一部分，也即本金，并依法予以追缴或没收。

综上所述，妨害药品管理罪中的非法获利是算本金的，它构成了犯罪行为的直接经济后果，并会受到法律的严厉制裁。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。