恶意克扣员工工资是违法的，不论克扣的金额多少。

在劳动关系中，用人单位应当严格按照劳动合同约定和国家法律规定向劳动者支付工资。恶意克扣工资，即使金额很小，也侵犯了劳动者的合法权益，违反了《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。

法律依据

• 《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
• 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也强调：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。

用人单位合法代扣情况

虽然恶意克扣工资是违法的，但法律也允许在特定情况下，用人单位基于法律规定或双方约定代扣劳动者工资，如代扣代缴个人所得税、社会保险费等。这些代扣行为必须有明确的法律依据和程序，且不得损害劳动者的合法权益。

劳动者权益救济途径

面对恶意克扣工资，劳动者可以通过以下途径维权：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位直接沟通，要求说明克扣理由并补足工资。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，由其对用人单位进行调查并责令改正。
3. 申请劳动仲裁：若投诉未能解决问题，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付克扣的工资及经济补偿。
4. 向法院提起诉讼：对仲裁结果不满时，可以在规定期限内向人民法院提起诉讼，以法律手段维护自身权益。

综上所述，恶意克扣员工工资是违法的，劳动者应了解自己的合法权益，并在遭遇此类情况时，通过合法途径积极维权。同时，用人单位也应遵守相关法律法规，确保按时足额支付劳动者工资，避免不必要的法律纠纷。如果你有任何关于劳动纠纷的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。