在不动产登记诉讼中，不动产部门可通过以下方式来维护其权益：

一. 明确自身权责与诉讼地位

1. 了解权责：不动产部门应首先明确自身在不动产登记过程中的权责，包括登记、审核、管理等职责，以及因登记错误或不当可能承担的法律责任。

   • 例如，若因登记错误导致权利人权益受损，不动产部门可能需承担相应的赔偿责任。

2. 确定诉讼地位：在诉讼中，不动产部门应根据具体情况确定自身的诉讼地位，是作为被告、第三人还是其他身份参与诉讼，以确保能够合法、有效地维护自身权益。

二. 积极应诉与举证

1. 积极应诉：当不动产部门收到诉讼通知时，应及时应诉，并按照法院的要求提交相关材料，如答辩状、证据等。

2. 充分举证：在诉讼过程中，不动产部门应充分举证，证明其登记行为的合法性、正当性以及不存在过错或过失。例如，可以提交登记资料、审核流程记录、相关法律法规依据等证据。

三. 依据法律法规进行抗辩

1. 引用相关法律法规：不动产部门在抗辩时，应明确引用相关法律法规，如《物权法》、《不动产登记暂行条例》等，以支持其观点和立场。

   • 例如，根据《物权法》的相关规定，不动产部门在登记时应尽到合理的审查义务，若已尽到审查义务且无过错，则可据此进行抗辩。

2. 分析案件事实与法律规定的契合度：不动产部门应详细分析案件事实与法律规定的契合度，指出诉讼请求与法律规定不符之处，以削弱对方的诉讼主张。

四. 加强与相关方的沟通与协调

1. 与当事人沟通：不动产部门可以与诉讼当事人进行沟通，了解其诉求和关注点，寻求和解或调解的可能性，以减少诉讼成本和时间成本。

2. 与其他部门协调：在诉讼过程中，不动产部门可能需要与其他相关部门（如自然资源部门、住建部门等）进行协调，共同应对诉讼问题，确保信息的准确性和一致性。

五. 总结与反思

1. 总结诉讼经验：不动产部门在诉讼结束后，应总结诉讼经验，分析诉讼过程中存在的问题和不足，以便在今后的工作中加以改进。

2. 反思登记工作：同时，不动产部门还应反思登记工作是否存在疏漏或不当之处，及时完善登记制度和工作流程，以提高登记质量和效率。

我建议不动产部门在维护权益时，应充分运用法律法规和诉讼策略，确保自身权益得到有效保护。同时，也应加强内部管理和制度建设，提高登记工作的规范性和准确性，从根本上减少诉讼风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。