办理侵犯知识产权刑事案件具体运用法律司法解释，主要包括对各类侵犯知识产权犯罪行为的认定、量刑标准以及诉讼程序中的特殊规定。以下是对此问题的详细分析：

一. 对侵犯知识产权犯罪行为的认定

1. 假冒注册商标罪

   • 未经注册商标所有人许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标，且达到一定的非法经营数额或违法所得数额的，构成假冒注册商标罪。
   • 法律依据：根据《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第一条，非法经营数额在五万元以上或者违法所得数额在三万元以上的，属于“情节严重”；非法经营数额在二十五万元以上或者违法所得数额在十五万元以上的，属于“情节特别严重”。

2. 销售假冒注册商标的商品罪

   • 销售明知是假冒注册商标的商品，销售金额达到一定数额的，构成销售假冒注册商标的商品罪。
   • 法律依据：根据《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第二条，销售金额在五万元以上的，属于“数额较大”；销售金额在二十五万元以上的，属于“数额巨大”。

3. 非法制造、销售非法制造的注册商标标识罪

   • 伪造、擅自制造他人注册商标标识或者销售伪造、擅自制造的注册商标标识，数量达到一定标准或非法经营数额、违法所得数额达到一定数额的，构成非法制造、销售非法制造的注册商标标识罪。
   • 法律依据：根据《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第三条，伪造、擅自制造或者销售伪造、擅自制造的注册商标标识数量在二万件以上，或者非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在三万元以上的，属于“情节严重”；相应数额更高的，属于“情节特别严重”。

4. 侵犯著作权罪

   • 以营利为目的，实施侵犯著作权行为，违法所得数额达到一定标准或非法经营数额达到一定数额的，构成侵犯著作权罪。
   • 法律依据：根据《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第五条，违法所得数额在三万元以上的，属于“违法所得数额较大”；违法所得数额在十五万元以上的，属于“违法所得数额巨大”。

二. 量刑标准

• 对于各类侵犯知识产权犯罪，根据犯罪情节的严重程度，量刑标准也有所不同。一般来说，情节越严重，量刑越重。
• 法律依据：根据《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》的相关规定，对于各类侵犯知识产权犯罪，均明确规定了“情节严重”和“情节特别严重”的量刑标准。

三. 诉讼程序中的特殊规定

1. 商业秘密的保密措施

   • 在刑事诉讼程序中，对于涉及商业秘密的证据、材料，当事人、辩护人、诉讼代理人或者案外人可以申请采取保密措施。
   • 法律依据：根据《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第六条，在刑事诉讼程序中，应当根据案件情况采取必要的保密措施。

2. 罚金的确定

   • 对于侵犯知识产权犯罪的，应当综合考虑犯罪违法所得数额、非法经营数额、给权利人造成的损失数额、侵权假冒物品数量及社会危害性等情节，依法判处罚金。
   • 法律依据：根据《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第十条，罚金数额一般在违法所得数额的一倍以上五倍以下确定。

我建议在办理侵犯知识产权刑事案件时，应严格遵循相关司法解释的规定，确保案件的公正、公平处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。