夫妻双方的公司不算一人公司。以下是对此结论的详细解释：

1. 一人公司的定义：

   • 一人公司是指只有一个自然人股东或者一个法人股东的有限责任公司。

2. 夫妻双方公司的性质：

   • 夫妻双方共同出资设立的公司，即使夫妻双方持有公司100%的股权，但因为股东数量为两人（即夫妻双方），所以不符合一人公司“只有一个股东”的法定要求。

3. 法律实践中的认定：

   • 在法律实践中，夫妻二人成立的公司不会被直接认定为一人公司。夫妻财产的共同共有与公司财产的独立性是不同法律制度的内容，夫妻双方将财产投入到公司后即受《公司法》约束，公司财产的独立性并不因股东的夫妻身份而受到影响。

4. 特殊情况下的考量：

   • 如果公司章程或其他文件明确约定公司由其中一方股东实际掌控，另一方不参与经营管理，且在实际运营中确实如此，那么在法律认定时可能会倾向于将其视为类似一人公司的情况，但这并不等同于直接认定为一人公司。
   • 如果夫妻公司经营管理等各方面完全混同于夫妻共同生活财产，难以区分公司财产与家庭财产，可能会被“揭开公司面纱”，否定公司法人独立地位，夫妻对公司债务承担连带责任。但这同样不是基于“一人公司”的认定，而是基于公司法人人格否认制度的适用。

5. 新《公司法》的影响：

   • 新修订的《公司法》对一人公司的规定进行了更新，但并未改变一人公司“只有一个股东”的基本定义。因此，夫妻双方的公司仍然不符合一人公司的法定要求。

综上所述，夫妻双方的公司不被认定为一人公司。在处理相关法律事务时，应根据公司的实际股权结构、经营管理情况以及法律法规的规定进行具体分析。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。