同一基金公司发行的多只基金持有的股票完全相同，并不直接构成违法行为。但这一行为是否合法，还需考虑其背后的具体操作、动机以及是否违反了相关法律法规和监管规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 合规性考量：

   • 基金公司发行多只基金，并使其持有相同的股票，从表面看并不违反法律。然而，这种行为可能涉及基金合同的约定、基金的投资策略以及基金公司的内部控制和风险管理等方面。
   • 基金公司必须确保其行为符合《中华人民共和国证券投资基金法》等法律法规的规定，以及证监会的监管要求。例如，基金公司需要遵循公平交易原则，确保各基金之间的利益不发生冲突。

2. 潜在风险：

   • 如果基金公司未经充分披露和合理解释，就使多只基金持有相同的股票，可能会引发投资者的质疑和不满。这种行为可能被视为对投资者权益的不尊重，甚至可能构成欺诈行为。
   • 此外，如果基金公司未能有效管理这种投资策略带来的风险，如市场波动风险、流动性风险等，可能会对基金公司的稳健运营和投资者的利益造成不利影响。

3. 监管要求：

   • 证监会等监管机构对基金公司的投资行为有着严格的监管要求。基金公司需要定期向监管机构报告其投资情况，并接受监管机构的审查和监督。
   • 如果基金公司发现其投资行为存在合规问题或风险隐患，应及时向监管机构报告，并采取有效措施进行整改。

综上所述，同一基金公司发行的多只基金持有的股票完全相同并不直接构成违法行为，但基金公司需要确保其行为符合法律法规和监管要求，并有效管理相关风险。如果投资者对此类行为有疑虑或发现基金公司存在违规行为，应及时向监管机构举报或咨询专业律师以维护自身权益。