针对包庇生态环境保护违法行为的处理方式，我国有着明确的法律规定和严格的处罚措施。以下是对此问题的详细解答：

首先，需要明确的是，包庇生态环境保护违法行为是一种严重的失职行为，不仅违反了国家的法律法规，也损害了公共利益和生态环境。因此，对于这种行为，必须依法予以严惩。

根据《环境保护法》的相关规定，对于地方各级人民政府、县级以上人民政府环境保护主管部门以及其他负有环境保护监督管理职责的部门，如果其对所发现的环境违法行为进行包庇或掩饰，将视为失职之举。对于这类行为，法律明确规定了相应的处罚措施：

1. 行政处罚：对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，将给予记过、记大过或者降级等处分。这些处分措施旨在警示责任人，表明其行为已经违反了国家的法律法规，并需要承担相应的责任。
2. 严厉惩罚：如果情节更为严重，造成了严重后果，那么将给予撤职或者开除公职的严厉惩罚。这种惩罚措施体现了国家对环境违法行为零容忍的态度，也彰显了保护生态环境的决心。
3. 领导责任：除了对直接责任人进行处罚外，其主要负责人也需要承担相应的领导责任。如果部门存在包庇环境违法行为的情况，主要负责人应当主动引咎辞职，以示对失职行为的负责和反思。

综上所述，包庇生态环境保护违法行为将受到法律的严惩。这不仅是对违法者的惩罚，更是对生态环境保护的重视和维护。因此，我们应该坚决反对任何形式的包庇行为，积极支持和参与环境保护工作，共同守护我们的美丽家园。