功率因数不合格时，供电企业有告知义务。下面我将从法律角度和实际操作两个方面进行详细解释。

法律角度

根据相关法律法规，供电企业在与用户建立供电关系时，应当明确双方的权利和义务。其中，告知义务是供电企业的一项重要义务。当用户的功率因数不合格时，这可能会影响到电网的稳定运行和其他用户的正常用电，因此供电企业有义务及时告知用户相关情况。

具体来说，供电企业可以通过书面形式（如通知单、邮件等）或口头形式（如电话、短信等）告知用户功率因数不合格的情况，并说明可能产生的后果以及用户应当采取的措施。这样不仅可以确保用户的知情权，还可以促使用户及时采取措施纠正问题，避免进一步的损失。

实际操作

在实际操作中，供电企业通常会定期对用户的用电情况进行检查和监测，包括功率因数的检测。一旦发现用户的功率因数不合格，供电企业会及时与用户取得联系，告知相关情况，并给出建议或要求用户采取措施进行整改。

此外，供电企业还可能会在供电合同中明确约定功率因数的标准和要求，以及不合格时的处理方式和责任承担。这样可以在法律层面上进一步明确双方的权利和义务，为处理类似问题提供明确的依据。

综上所述，功率因数不合格时，供电企业有义务告知用户相关情况，并采取相应措施确保电网的稳定运行和其他用户的正常用电。如果你在这方面遇到了问题或疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。