关于运输合同纠纷中的逾期利息计算，我可以为你提供以下详细的解答：

首先，明确结论：运输合同纠纷中的逾期利息计算，主要依据合同中的约定。如果合同有明确约定逾期利息或违约金的计算方式，则按约定执行；如果合同无明确约定，但逾期造成了实际损失，通常可以参照当时的一年期贷款市场报价利率（LPR）来计算逾期付款损失，并可能在此基础上加计30%-50%作为逾期利息。

接下来，分类讨论：

1. 合同有明确约定的情况：

   • 当运输合同中明确规定了逾期利息或违约金时，只要该约定不违反法律法规的强制性规定，如未超过司法保护的利率上限，守约方即可依据合同条款要求违约方支付相应的利息或违约金。例如，合同中约定“托运方逾期支付运输费用，每逾期一日需按未支付金额的万分之五支付逾期利息”，则承运方可以依此条款主张逾期利息。

2. 合同无明确约定的情况：

   • 若合同中未明确约定逾期利息，但托运方逾期支付了运输费用，根据《民法典》的相关规定，托运方的行为构成违约，应承担违约责任。承运方因资金被占用而产生的损失，可以主张逾期利息。此时，通常会参照当时的一年期贷款市场报价利率（LPR）来计算逾期付款损失，并可能在此基础上适当增加一定比例的利息作为赔偿。
   • 若是承运方逾期交付货物，虽然直接提及“利息”可能不恰当，但托运方确因货物逾期交付而遭受了经济损失，可以尝试从资金占用的角度，参照一定的利率标准来主张损失赔偿。不过，托运方需承担举证责任，证明其损失与承运方的逾期交付之间存在直接的因果关系。

最后，给出建议：

• 为避免未来可能的纠纷，建议在签订运输合同时，双方应明确约定逾期利息、违约金等相关条款，以确保各自权益得到充分保障。
• 在发生逾期情况时，守约方应及时收集证据，如合同、付款记录、交货记录等，以便在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。
• 如果对逾期利息的计算或合同纠纷的处理有任何疑问，建议及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。

希望以上解答能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。