独立保函在特定情况下是可以被冻结的，但一般不得被扣划。

首先，从法律机制上来看，银行独立保函置换财产保全机制是一种创新性的担保方式，它允许被告通过提供银行独立保函来申请解除对其资金的冻结。在这一机制下，银行承诺若被告未按照生效法律文书履行付款义务，将在收到法院相关通知后无条件支付相应款项。因此，在独立保函有效期内，保函项下的资金或保证金通常会被视为特定化，并移交给开立人占有。

关于独立保函的冻结与扣划，根据《最高人民法院关于审理独立保函纠纷案件若干问题的规定》第二十四条第一款，对于按照特户管理并移交开立人占有的独立保函开立保证金，人民法院可以采取冻结措施，但不得扣划。这是因为该保证金是被执行人给银行的保证，一旦失去了该笔保证金，银行可能面临无法挽回的损失。只有当保证金账户内的款项丧失开立保证金的功能时，人民法院才可以依法采取扣划措施。

综上所述，独立保函在特定情况下是可以被冻结的，以作为担保措施的一部分。然而，除非保证金丧失其保证功能，否则人民法院一般不得对独立保函项下的资金或保证金进行扣划。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。