公司设立电子签名可以通过多种方式进行，具体包括数字证书签名、建行个人手机银行认证方式签名、电子营业执照签名以及音视频双录认证等。以下是详细步骤及注意事项：

一. 数字证书签名

1. 下载安装：签名人需在深圳市市场监督管理局网上注册系统下载安装相应数字证书发放机构的驱动程序。
2. 插入证书：在电脑USB接口处插入数字证书，打开证书客户端。
3. 选择证书并签名：在电子申请表签名域上点击鼠标，选择证书后点击[签名]即可完成。

• 例如，使用工商银行的个人U盾证书进行签名，需要确保已下载并安装了中国工商银行的数字证书驱动程序。

二. 建行个人手机银行认证方式签名

1. 适用范围：此方式适用于内资有限责任公司的设立、变更（备案）部分事项及一般注销业务。
2. 开通功能：需先到建行网点开通手机银行并完成商事登记移动认证功能签约。
3. 进行签名：按照系统提示使用手机银行完成电子签名。

三. 电子营业执照签名

1. 适用对象：统一社会信用代码开头为91的企业，特别是非深圳本地企业。
2. 签名流程：使用电子营业执照进行签名，支持同一笔业务多个企业使用。

• 例如，在设立内外资有限公司时，可以使用电子营业执照进行全流程网上签名。

四. 音视频双录认证签名

1. 适用范围：适用于所有网上全流程一般/简易注销业务及个体户设立、内外资有限公司设立业务。
2. 身份类型：持有有效身份证、港澳台居民居住证等自然人可使用。
3. 签名方式：通过音视频双录方式进行身份认证并完成电子签名。

我建议根据公司实际情况和具体需求选择合适的电子签名方式。在签名过程中，请确保信息的真实性和准确性，并妥善保管好相关数字证书、电子营业执照等敏感信息。如有进一步需要，您可以继续咨询我。