公司进入清算程序后，股东代表诉讼通常是可以继续进行的。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国公司法》第一百五十一条的规定，当公司的合法权益受到不法侵害，且公司怠于行使诉权时，符合法定条件的股东有权以自己的名义代表公司提起诉讼。这一规定在公司清算期间同样适用，因为虽然公司处于清算阶段，但只要公司尚未注销，其法人资格仍然存在，股东仍可行使其法定权利。

二、具体情形与程序

1. 清算组未成立或未履行职责时：

   • 若公司解散后尚未成立清算组，或清算组成立后未履行其职责（如未对侵害公司利益的行为提起诉讼），股东在发现公司权益受损时，有权提起股东代表诉讼。

2. 已向清算组提出请求但未被响应时：

   • 股东在发现公司权益受损后，应首先向清算组提出书面请求，要求清算组提起诉讼。
   • 若清算组拒绝提起诉讼，或自收到请求之日起三十日内未提起诉讼，或情况紧急、不立即提起诉讼将会使公司利益受到难以弥补的损害时，股东可以依法以自己的名义直接向人民法院提起诉讼。

三、注意事项

1. 股东资格与前置程序：

   • 提起股东代表诉讼的股东需符合法定条件，如有限责任公司中单独或合计持有公司一定比例股份的股东，且持股时间需满足连续一百八十日以上的要求。
   • 股东在提起诉讼前，需确保已履行了前置程序，即向清算组（或原法定代表人）提出了书面请求，并等待了合理的期限。

2. 诉讼目的与证据收集：

   • 股东代表诉讼的本质是股东代位公司提起诉讼，其直接出发点是为了保护公司整体利益，而非个人利益。
   • 股东在提起诉讼时，应收集充分的证据来支持其诉讼请求，并确保诉讼请求的合理性和合法性。

3. 配合清算程序：

   • 在诉讼过程中，股东应积极配合清算组的工作，确保诉讼活动不影响清算工作的正常进行。

综上所述，公司进入清算程序后，股东代表诉讼通常是可以继续进行的。但股东在行使这一权利时，需严格遵循法律规定的程序和条件，并确保诉讼目的的正当性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。