关于“机关单位的保密责任由谁承担”这一问题，其核心在于明确保密责任的主体及其具体职责。以下是对此问题的详细解答：

一、保密责任主体

机关单位的保密责任主要由以下主体共同承担：

1. 保密行政管理部门：

   • 国家保密行政管理部门负责全国保密工作的监管和指导。
   • 地方各级保密行政管理部门则主管本行政区域内的保密工作，监督并指导本地机关单位的保密实践。

2. 机关单位内部的保密工作机构：

   • 这些机构（如保密委员会、保密办等）专门负责本单位的保密管理或指导工作。
   • 由单位主要领导担任负责人，成员包括各重要业务部门的领导，共同制定和执行保密制度，监督各部门严格执行。

3. 全体工作人员：

   • 机关单位全体工作人员，包括在编人员、合同制人员、临时工等，都有保守国家秘密的义务。

二、具体保密责任

1. 保密行政管理部门的责任：

   • 制定并执行相关保密法律法规。
   • 监督并指导机关单位的保密工作实践。
   • 对违反保密规定的行为进行查处。

2. 机关单位内部保密工作机构的责任：

   • 建立健全本单位保密管理制度。
   • 对工作人员进行保密教育培训。
   • 管理涉密人员、文件资料及设备等。
   • 定期开展保密检查，及时发现并消除隐患。

3. 全体工作人员的责任：

   • 严格遵守保密法律法规和本单位保密制度。
   • 不在公共场所谈论涉密事项，不在个人通信中泄露秘密。
   • 对发现的泄密行为及时报告。

三、法律责任

机关单位及其工作人员违反保密法规定，将依法承担包括行政责任、刑事责任（如构成犯罪）、民事责任（如适用）及党纪处分（对党员）在内的多重责任。具体责任形式包括警告、记过、降级、撤职、开除、经济赔偿、刑事责任追究等。

综上所述，机关单位的保密责任是一个多层次、多部门共同协作的综合性任务，需要保密行政管理部门、机关单位内部的保密工作机构以及全体工作人员的共同努力和共同承担。通过明确责任主体和具体职责，以及加强法律责任追究，可以确保保密工作的有效实施和持续改进。