提供虚假材料申请两用物项许可证是违法的。具体分析如下：
一. 提供虚假材料申请行政许可的违法性
法律依据明确：根据《中华人民共和国行政许可法》第七十九条，以及《医疗器械监督管理条例》(2020年修订)第八十三条第一款的规定，提供虚假资料或者采取其他欺骗手段申请行政许可的，是不被允许的。虽然这两部法规是针对医疗器械领域的，但其中的法律原则同样适用于两用物项许可证的申请。提供虚假材料申请任何类型的行政许可，都是违法的。
行政处罚严厉：如江苏省药品监督管理局的行政处罚案例所示，使用虚假资料申请二类医疗器械许可的企业，不仅被撤销了已取得的注册证，还被没收了违法所得，并处以高额罚款。这种严厉的行政处罚同样会适用于提供虚假材料申请两用物项许可证的行为。
二. 两用物项许可证的特殊性
监管严格：两用物项通常指的是既有民用又有军用或可能用于军事目的的物品，因此其监管通常更为严格。申请两用物项许可证时，必须提供真实、准确的材料，以确保物品的使用符合法律法规和国家安全要求。
法律后果严重：如果提供虚假材料申请两用物项许可证，不仅可能面临行政处罚，还可能涉及刑事责任。因为这种行为可能危害国家安全或社会公共利益，构成犯罪。
我建议：在申请两用物项许可证时，务必提供真实、准确的材料，并严格遵守相关法律法规。如有进一步需要，您可以继续咨询我。