认定事实合同关系需综合考虑双方的实际行为、意思表示一致、交易习惯、行业惯例以及其他相关证据。以下是详细分析：
实际行为：
- 双方当事人的实际履行行为是认定事实合同关系的核心。这包括一方发出要约，另一方以实际行动或明确表示接受该要约，并履行了相应的义务，如供货、提供服务或支付款项等。这些行为共同构成了合同的实际履行，是认定事实合同关系最直接的依据。
意思表示一致：
- 尽管事实合同关系可能缺乏明确的书面形式或口头约定，但双方当事人必须就合同的主要条款达成一致意见。这可以通过双方的沟通记录、行为模式或行业惯例来推断。只要双方对合同的核心内容有共识，并以实际行动表示接受，即可视为意思表示一致。
交易习惯与行业惯例：
- 在某些行业或领域中，特定的交易习惯或惯例被视为双方默示的合同条款。这些习惯或惯例能够补充或解释双方行为中的不明确之处，并作为认定事实合同关系的重要参考。它们必须被双方所认可，且符合行业内的通常做法。
其他相关证据：
- 除了上述因素外，还应考虑其他能够佐证合同实际履行的证据。这包括但不限于银行转账记录、交货凭证、运输单据、聊天记录、电子邮件、服务提供证据、接受服务证据以及业务往来文件等。这些证据能够形成完整的证据链，进一步支持事实合同关系的认定。
综合判断与谨慎性：
- 在认定事实合同关系时，法院会综合考虑上述所有因素，并根据具体情况进行判断。由于事实合同关系缺乏明确的书面形式，因此在发生纠纷时可能更难证明。因此，在实际交易中，建议尽可能采用书面形式来明确合同条款，以减少潜在的纠纷和风险。
我建议，在认定事实合同关系时，应全面、客观地收集和分析相关证据，确保准确判断双方是否存在具有法律约束力的合同关系。同时，对于已经存在的事实合同关系，应妥善保留相关证据，以便在必要时进行维权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。