医疗纠纷次要责任赔偿计算办法是：赔偿金额 = 损害总额 × 医疗机构责任比例，其中责任比例通常在20%至40%之间。具体分析如下：

一. 损害总额的计算

损害总额是患者因医疗事故所遭受的全部直接和间接损失的总和，包括但不限于：

• 医疗费：根据医疗机构出具的收款凭证，结合病历和诊断证明确定，包括医药费、住院费等。
• 误工费：考虑受害人的误工时间和收入状况，误工时间依据医疗机构证明或定残日确定。
• 护理费：依据护理人员的收入、护理人数和期限计算，无收入者参照当地护工标准。
• 交通费：实际发生的就医或转院费用，需有正式票据支持。
• 住院伙食补助费：参照当地国家机关出差伙食补助标准。
• 残疾生活补助费、残疾用具费：根据伤残等级和需要配置的功能器具计算。
• 丧葬费、被扶养人生活费：按照规定的标准计算。
• 精神损害抚慰金：根据医疗事故发生地居民年平均生活费计算。

二. 责任比例的评估

医疗机构在事故中的责任比例是赔偿计算的关键。次要责任意味着医疗机构在事故中承担部分过错，通常这个比例在20%至40%之间。具体比例会由法官或相关机构根据案件的实际情况，比如患者的疾病状况、医疗行为的过错程度、医疗风险的可预见性等因素来综合判定。

三. 赔偿金额的计算

在确定了损害总额和医疗机构的责任比例后，就可以通过简单的乘法运算来得出医疗机构应承担的赔偿金额。例如，如果损害总额为100万元，医疗机构被判定承担30%的次要责任，那么医疗机构应赔偿的金额就是30万元。

我建议在处理医疗纠纷次要责任赔偿问题时，患者和医疗机构应首先尝试通过协商或调解来解决争议。如果无法达成一致，患者可以向卫生行政部门提出调解申请，或者直接向人民法院提起民事诉讼。在整个过程中，患者应妥善保管所有与医疗事故相关的证据，以便在需要时提供证明。如有进一步需要，您可以继续咨询我。