当公司倒闭时，对于怀孕初期的孕妇员工，赔偿问题需根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规来处理。以下是详细的赔偿标准、计算方式及操作流程：
赔偿标准与计算方式
经济补偿金：
- 计算基数：按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资定义：这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。若工作时间不足十二个月，则按实际工作月数计算平均工资。
- 特殊保护：若公司因孕妇怀孕而违法解除劳动合同，需按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
“三期”待遇保障：
- 孕期、产期、哺乳期：虽然公司倒闭导致劳动合同终止，但对于孕期、产期、哺乳期的女职工，公司应继续支付工资及社保至相应期限结束，或协商一次性支付相关费用。
- 生育津贴：若公司已缴纳生育保险，孕妇可申领生育津贴；若未缴纳，则由公司承担生育津贴和生育医疗费用的相关支付责任。
代通知金（如适用）：
- 若公司未提前三十日书面通知孕妇解除劳动合同，需额外支付一个月工资作为代通知金。
操作流程与注意事项
确认劳动关系状态：
- 首先确认劳动合同是否仍然存续，以及公司是否已进入破产清算程序。
与公司协商：
- 主动与公司沟通赔偿方案，要求依法支付经济补偿金、“三期”待遇等。
申请劳动仲裁：
- 若与公司协商未果，孕妇可向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，需准备劳动合同、工资流水等相关证据以支持自己的主张。
参与破产清算（如适用）：
- 在公司破产清算过程中，职工债权优先于普通债权受偿。孕妇应关注清算进展，确保自己的权益得到保障。
法律救济途径：
- 若对仲裁结果不服，孕妇可在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
综上所述，公司倒闭时，对于怀孕初期的孕妇员工，应依法给予经济补偿金、“三期”待遇保障等。若公司拒绝支付或协商未果，孕妇可通过申请劳动仲裁、参与破产清算等法律途径来维护自己的合法权益。