针对初级农产品被打假人投诉三无（无生产日期、无质量合格证、无生产厂家）的问题，商家应当采取一系列积极、合规的应对措施，以下提供清晰、详细、有深度的解答：
一、立即核查与下架
核查产品：商家在接到投诉后，应立即对涉诉的初级农产品进行核查，确认是否存在三无问题。核查内容包括但不限于产品的生产日期、质量合格证、生产厂家信息等。
下架问题产品：如果核查发现产品确实存在三无问题，商家应立即下架该产品，并停止销售，以避免进一步的法律风险。
二、配合监管与提供证据
配合调查：商家应积极配合相关监管部门的调查，提供必要的协助和配合，包括但不限于提供产品来源证明、质量检测报告等。
提供证据材料：为了证明自身的合法合规性，商家应准备并提交相关证据材料，如进货单据、供应商资质证明、产品检测报告等。这些证据将有助于监管部门了解产品的真实情况，并作为商家合规性的重要依据。
三、积极整改与沟通
积极整改：商家应根据监管部门的意见和要求，对存在的问题进行积极整改，包括但不限于完善产品标识、加强质量管理等。整改完成后，应向监管部门提交整改报告，以证明已采取有效措施解决问题。
与打假人沟通：商家可以考虑与打假人进行沟通，了解其举报的具体原因和诉求，寻求和解的可能性。但需注意，任何和解都应在法律允许的范围内进行，避免陷入更大的法律风险。同时，商家应保持冷静和理性，避免与打假人产生不必要的冲突。
四、了解法律后果与应对
法律后果：根据《产品质量法》等相关法律法规，销售三无产品将面临责令改正、责令停止生产销售、罚款等处罚。情节严重的，还可能面临没收违法所得等更严厉的处罚。
应对策略：商家应充分了解相关法律法规和处罚标准，以便在面临法律后果时能够做出正确的应对。同时，商家应加强内部管理，确保销售的产品符合质量标准，避免再次出现类似问题。
五、总结与建议
初级农产品被打假人投诉三无问题是一个严重的法律风险点，商家应高度重视并采取有效措施进行应对。建议商家加强产品质量管理，完善产品标识和质量检测体系，确保销售的产品符合质量标准。同时，商家应加强与监管部门的沟通和合作，及时了解政策动态和监管要求，确保自身的合规性。在面临投诉和举报时，商家应保持冷静和理性，积极采取措施进行应对，并寻求法律支持和专业帮助。