结论前置：在司法实践中，第一次开庭为被告，第二次开庭身份变更为第三人的情况，其程序合法性需根据具体案情和法律规定来判断。一般来说，如果这种身份变更符合法律程序和规定，则是合法的。

分析说明：

1. 身份变更的法律依据：在诉讼过程中，当事人的诉讼地位可能会因案情发展、证据变化等因素而发生变化。如果法律允许在特定情况下将被告变更为第三人，且该变更符合法定程序和条件，那么这种变更就是合法的。例如，在某些情况下，原本作为被告的当事人可能因新证据的出现而被证明并非真正的责任方，此时将其变更为第三人可能更为合适。

2. 程序合法性的判断：要判断这种身份变更的程序是否合法，需要考察以下几个方面：

   • 变更是否符合法律规定：即是否有明确的法律依据支持这种变更。
   • 变更是否经过法定程序：如是否需要法院裁定、是否通知了相关当事人等。
   • 变更是否损害了其他当事人的合法权益：如果变更导致其他当事人的诉讼权利受到不当限制或损害，那么这种变更可能是不合法的。

3. 具体案情的考量：每个案件都有其独特的事实和背景，因此在判断身份变更的合法性时，必须结合具体案情进行考量。例如，需要考察变更的原因是否合理、是否有充分的证据支持变更等。

总结：综上所述，第一次开庭为被告，第二次开庭身份变更为第三人的程序合法性，需根据具体案情和法律规定来判断。如果这种身份变更符合法律程序和规定，且未损害其他当事人的合法权益，那么它就是合法的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。