公司法人将个人车辆卖给公司，价格应由双方协商确定，并确保价格公平合理，通常可以参考市场价格或评估价值。以下是详细分析：

一. 价格确定原则

1. 协商确定：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，法人与个人（即使为同一人）之间的交易应遵循自愿、公平、等价有偿、诚实信用、守法和法律尊重社会公德等原则。因此，公司法人与公司之间的车辆转让价格，应由双方基于车辆的实际状况、市场价值等因素协商确定。
2. 参考市场价格：为了确保交易价格的公平合理，双方可以参考同类车型在市场上的销售价格，或者通过专业的车辆评估机构对车辆进行评估，以评估价值作为交易价格的参考。

二. 税务考虑

1. 增值税：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》，公司销售货物（包括车辆）需要缴纳增值税。因此，当公司法人将个人车辆卖给公司时，如果车辆是作为二手车销售，且公司属于增值税一般纳税人，那么需要按照增值税的规定计算并缴纳增值税。
2. 个人所得税：对于公司法人个人而言，将车辆卖给公司可能涉及财产转让所得的个人所得税。根据《中华人民共和国个人所得税法》，财产转让所得应当缴纳个人所得税，具体税额根据转让所得（即销售价格减去车辆原值及相关税费后的净收益）和适用税率计算。

三. 实际操作建议

1. 签订合同：双方应签订正式的车辆转让合同，明确交易价格、付款方式、车辆交付时间等关键条款，并确保合同内容符合法律法规的要求。
2. 税务申报：完成交易后，公司应及时向税务机关申报并缴纳相关税费，同时公司法人也应就财产转让所得依法申报个人所得税。

综上所述，公司法人将个人车辆卖给公司时，价格应由双方协商确定，并参考市场价格或评估价值以确保公平合理。同时，双方还应注意税务方面的规定，确保交易合法合规。如有进一步需要，您可以继续咨询我。