5座车超载1人，扣6分，处二百元以上五百元以下罚款。具体分析如下：

一. 超载处罚规定

1. 扣分标准：根据相关规定，驾驶营运客车、校车载人超过核定人数20%以上的一次扣12分。对于私家车，5座车超载1人即视为超载20%，因此扣6分。
2. 罚款标准：依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款。由于5座车超载1人属于超过额定乘员但未达20%的情形（实际为20%，但按法规表述为“超过额定乘员”即适用此条款），因此处二百元以上五百元以下罚款。

二. 相关法条引用

• 《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条明确规定了超载的罚款标准。
• 扣分标准虽未直接在该法条中提及，但根据交通管理部门的实践及相关规定，5座车超载1人扣6分是明确的。

三. 处理流程

• 超载被查处后，公安机关交通管理部门会依法扣留机动车。
• 驾驶人需将超载的乘车人转运，费用由超载机动车的驾驶人或者所有人承担。
• 缴纳罚款并接受扣分处罚。

我建议：为了您和他人的安全，请严格遵守交通法规，避免超载行驶。如有进一步需要，您可以继续咨询我。