保密文件丢失的后果可能涉及民事责任、行政责任乃至刑事责任。具体分析如下：

一. 民事责任

• 如果保密文件是通过快递等方式寄送过程中丢失，且该文件进行了保价，那么根据《快递暂行条例》第二十七条，对保价的快件，应当按照经营快递业务的企业与寄件人约定的保价规则确定赔偿责任。也就是说，寄件人可以要求快递公司按照保价额进行赔偿。

二. 行政责任

• 如果丢失的保密文件属于国家所有的档案，那么根据《中华人民共和国档案法》第四十八条，单位或者个人丢失属于国家所有的档案的，由县级以上档案主管部门、有关机关对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。这意味着，相关责任人可能会面临行政处分。

三. 刑事责任

• 如果国家机关工作人员故意丢失泄密文件，致使国家秘密泄露，情节严重的，根据《中华人民共和国刑法》第三百九十八条，需要承担刑事责任，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。非国家机关工作人员犯此罪的，也会依照前款规定酌情处罚。

综上所述，保密文件的丢失后果严重，不仅可能涉及经济赔偿，还可能对责任人产生行政乃至刑事上的影响。因此，建议相关单位和个人应严格遵守保密规定，确保保密文件的安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。