职务侵占债权债务的认定是一个涉及法律判断的问题，主要依据以下几个方面进行综合考量：

一、职务侵占行为对公司财产的影响

首先，要明确职务侵占行为是否导致公司财产受损。这部分受损财产所对应的债权债务关系必须清晰。如果侵占行为导致公司失去了对特定债权的追索权，那么该债权就应从公司资产中扣除。同时，因职务侵占而形成的债务，如果是因为侵占行为而产生的不合理支出（如用于个人消费等），则不应由公司承担，应从公司债务中去除。

二、行为人占有财物的合法性

判断有债务关系时是否构成职务侵占，关键在于行为人占有财物是否有合法理由。如果行为人是为了合理实现债权而占有财物，且手段、程度合理，通常不认定为职务侵占。但是，如果行为人以债务为借口，非法占有远超债务数额的财物或采取违法手段占有财物，则可能构成职务侵占。

三、职务侵占数额的认定

在存在债务关系的情况下，认定职务侵占罪数额时，需先明确职务侵占的基础标准。根据相关规定，职务侵占数额在三万元以上的，应认定为“数额较大”；数额在一百万元以上的，认定为“数额巨大”。若存在债务关系，应准确区分合法债务部分与非法侵占部分，将行为人所侵占的财物数额减去其合法债权数额，剩余的部分才是职务侵占的犯罪数额。

四、法律处理与量刑标准

职务侵占罪是指公司、企业或其他单位的人员，利用职务便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。存在债务关系并不影响职务侵占罪的定罪，但在量刑时可能会作为情节考量。根据《刑法》规定，数额较大的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金。在司法实践中，若因债务纠纷引发，行为人主观恶性、行为社会危害性可能相对降低，法院量刑时可能酌情从轻。

综上所述，职务侵占债权债务的认定需要综合考虑多个方面，包括职务侵占行为对公司财产的影响、行为人占有财物的合法性、职务侵占数额的认定以及法律处理与量刑标准等。在处理此类问题时，应确保事实清楚、证据确凿，并依法进行公正、合理的判断。