公司扣绩效工资是否合法，主要取决于多个因素，包括绩效考核制度的合法性、明确性，扣除比例的合理性，以及扣除后工资是否低于最低工资标准等。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法情况：

   • 绩效考核制度合法且明确：如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了绩效工资的考核标准、发放方式及扣减情形，并且这些规定经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），同时已向员工公示或告知，那么公司在员工绩效不达标时扣减绩效工资通常是合法的。
   • 经济损失赔偿：当员工因故意或重大过失给公司造成经济损失时，公司可按照劳动合同约定要求其赔偿，但赔偿的扣除需符合《工资支付暂行规定》，即每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 不合法情况：

   • 绩效考核制度不合法或不明确：如果绩效考核制度本身不合法，未经过民主程序制定，或考核标准模糊不清、随意变更，或未提前向员工公示告知，那么以绩效考核为由扣除工资是违法的。
   • 无正当理由随意扣减：公司无正当理由随意扣减员工的绩效工资，或以绩效之名行克扣工资之实（如为惩罚员工、强迫离职等恶意扣减），均属违法行为。
   • 扣除后工资低于最低工资标准：即使绩效考核制度合法，但如果扣除绩效工资后员工的实际工资低于当地最低工资标准，这种扣除也是违法的。

在面对公司扣绩效工资的情况时，员工应首先了解自己的权益，并知道如何维护。具体途径包括：

• 与用人单位协商解决：员工应与用人单位沟通协商，了解扣减绩效工资的具体原因和依据，并表达自己的意见和诉求。
• 向劳动行政部门投诉：若协商无果，员工可向当地劳动行政部门投诉，寻求政府部门的帮助和支持。
• 申请劳动仲裁或提起诉讼：如问题仍无法解决，员工可向劳动仲裁机构申请仲裁，或在必要时向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自身合法权益。

综上所述，公司扣绩效工资是否合法需综合考虑多个因素。员工在面临此类问题时，应充分了解自己的权益和维权途径，并在必要时寻求法律帮助以确保自身权益不受侵害。