当软著证明材料超过60页时，需要按照相关规定进行部分提交。具体来说，处理方式如下：

一. 源代码和说明书的处理

1. 源代码：

   • 若超过60页，则只需提供前30页和后30页。
   • 每页不少于50行，且每页行数需保持一致。
   • 每页必须标明页码（可编辑成1-60页顺序排列），如有页眉，必须是软件全称加版本号。
   • 代码中不要出现空白行，多个尾括号单独占行的合并到代码行，尽量不要出现注释行。源码中不要出现开发人员姓名，出现的日期要在软件开发完成日期之前。

2. 说明书（或操作手册）：

   • 若超过60页，则只需提供前30页和后30页。
   • 如有页眉，必须是软件全称加版本号。
   • 操作手册中的操作界面、手册内容中不能包含与软件登记表记载的软件名称、公司名称不相符的其他软件名称和公司名称。

二. 结束页的处理

• 当源代码或说明书超过60页时，提到的“结束页”主要是为了清晰界定你的贡献范围，并不是说一定要放在第60页。关键是确保评审人员明白这六十页包含了完整且独立的功能单元或开发阶段。
• 如果有必要的话，可以在适当的位置添加一句总结性的话语来标记这一界限。结束页更像是一个逻辑分界点，表明后续的内容不再作为你申请著作权保护的部分。它可能是最后一个编译或打包后的程序块，或者是有明确注释说明从这里开始是其他开发者的工作的地方。

三. 其他注意事项

• 软件名称：软件全称必须是以软件、系统、平台为结尾。
• 申请流程：首先前往中国版权保护中心注册账户，然后填写软件申请信息和软件开发信息，包括软件功能与特点。将准备好的材料打印出来，选择现场提交。提交后，可以登录中国版权保护中心官网查看进度。
• 审查时间：普通申请顺利情况下60天内下证，具体看版权局的审查速度。

我的观点：在处理软著证明材料超过60页的情况时，务必严格按照上述规定进行部分提交，以确保申请的顺利进行。同时，保持申请材料的规范性和完整性也是非常重要的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。