母公司设定付款义务的法律依据主要来源于公司法的相关规定以及合同法的相关原则。具体来说：
公司法规定：
- 母公司作为法人实体，具有独立的法律地位和财产权。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司可以依法进行各种民事活动，包括设定付款义务。
- 母公司在经营管理过程中，为了业务发展的需要，可以与子公司或其他第三方签订购销合同、服务合同等，这些合同中往往会明确设定付款义务。这些付款义务一旦在合同中约定，即具有法律约束力，母公司应当按约履行。
合同法原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》中合同编的规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。合同一旦成立，即对当事人具有法律约束力。
- 母公司在签订合同时，应当遵循平等、自愿、公平、诚实信用的原则，确保合同内容的合法性和有效性。如果合同中设定了付款义务，母公司应当按约履行，否则将承担违约责任。
综上所述，母公司设定付款义务的法律依据主要来源于公司法的相关规定以及合同法的相关原则。在实际操作中，母公司应当严格遵守法律法规和合同约定，确保付款义务的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。